More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0907 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0907  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 535 aa  1091    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 858 aa  191  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 864 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 		 859 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 		 861 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 		 860 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.74 
 
 		 903 aa  153  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 602 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 		 911 aa  126  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  38.56 
 
 		 423 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  37.71 
 
 		 612 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 357 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1014 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 1017 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  31.31 
 
 		 429 aa  107  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3238  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  33.33 
 
 		 662 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0144494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  33.87 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 711 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 571 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  22.12 
 
 		 562 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  37.28 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3639  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  38.22 
 
 		 547 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00185015  normal  0.0105552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.12 
 
 		 362 aa  97.8  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  21.83 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 373 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 719 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 		 371 aa  90.5  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 		 574 aa  90.1  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 647 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 662 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 677 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 815 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  34.24 
 
 		 505 aa  87.8  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.74 
 
 		 356 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 545 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 366 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 634 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000423635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 2783 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 		 748 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 819 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 911 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 958 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 1174 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.5 
 
 		 995 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.08 
 
 		 819 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  26.13 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 2161 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  31.65 
 
 		 2888 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  28.79 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  29.82 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  30.46 
 
 		 767 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 905 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 		 726 aa  77  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1211 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 3470 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.16 
 
 		 860 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  30.61 
 
 		 771 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2248  putative GAF sensor protein  29.87 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 1877 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.75 
 
 		 957 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  29.44 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 801 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.18 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.73 
 
 		 713 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  24.64 
 
 		 971 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 880 aa  70.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 725 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  20.76 
 
 		 756 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  33.87 
 
 		 738 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  22.74 
 
 		 785 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 2153 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  27 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  28.14 
 
 		 736 aa  67.4  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  24.21 
 
 		 969 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 		 576 aa  67  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.43 
 
 		 981 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 857 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 		 686 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  27.75 
 
 		 772 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  20.19 
 
 		 1255 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 		 746 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  21.45 
 
 		 733 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  28.99 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  27.98 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  30.82 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 659 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 539 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  22.31 
 
 		 1020 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 		 568 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 692 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>