More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0874 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  55.1 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  52.9 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  51.32 
 
 		 308 aa  288  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  47.8 
 
 		 302 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  46.18 
 
 		 303 aa  281  8.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  50 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 		 298 aa  280  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  48.3 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  47.19 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  49.03 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  48.06 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 299 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 299 aa  275  7e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  47.74 
 
 		 310 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  47.44 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  48.01 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  47.74 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  46.2 
 
 		 303 aa  268  7e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  46.44 
 
 		 300 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  46.82 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 		 296 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  44.44 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  47.7 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  45.12 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  45.24 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  45.24 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  47.96 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  43.23 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  45.48 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  45.73 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  47.19 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  42.44 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  43.24 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  46.53 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  44.04 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  45.24 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 		 298 aa  245  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  47.49 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  43.09 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  43.81 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 		 318 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 312 aa  241  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.25 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  46.08 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  44.97 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  40.89 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  44.95 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.18 
 
 		 451 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>