186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0820 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  100 
 
 
192 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  53.04 
 
 
194 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  53.61 
 
 
188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  31.52 
 
 
187 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  37.06 
 
 
193 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  42.14 
 
 
193 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  38.96 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  38.32 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.11 
 
 
190 aa  111  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.36 
 
 
508 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  35.9 
 
 
502 aa  109  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.66 
 
 
189 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  29.52 
 
 
213 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  29.52 
 
 
213 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.62 
 
 
502 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  39.58 
 
 
177 aa  104  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  31.18 
 
 
204 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.86 
 
 
195 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  30.06 
 
 
195 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.54 
 
 
211 aa  101  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  31.82 
 
 
502 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.72 
 
 
497 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  31.82 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.76 
 
 
200 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  38.14 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  30.3 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  26.95 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  27.16 
 
 
202 aa  94.7  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  26.4 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  29.22 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  29.63 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  29.63 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  29.37 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  30.25 
 
 
216 aa  90.9  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  28.18 
 
 
210 aa  89  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.63 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.63 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  30.25 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  32.37 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  28.48 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  22.89 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  42.11 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  36.59 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.14 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  29.68 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  45.33 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  31.53 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.31 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.33 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  29.17 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  30.53 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  43.42 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.36 
 
 
230 aa  72  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  28.68 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  35.05 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.47 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  28.78 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  30.4 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  38.75 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.75 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  38.75 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  33.02 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  37.76 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  40.79 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.59 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.43 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  35.06 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  37.65 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  34.18 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.69 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 
367 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.69 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0309  succinate dehydrogenase subunit B  27.92 
 
 
344 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.24045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.26 
 
 
385 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  31.25 
 
 
533 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06190  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  24.84 
 
 
328 aa  59.7  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  32.39 
 
 
412 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  29.21 
 
 
386 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  31.82 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  31.51 
 
 
423 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  30.12 
 
 
372 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1884  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.46 
 
 
402 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.561608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.41 
 
 
280 aa  55.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.12 
 
 
384 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  23.57 
 
 
325 aa  55.1  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
416 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0489  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  23.46 
 
 
321 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  25.47 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  34.62 
 
 
375 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  25.47 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.49 
 
 
384 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  25.47 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1872  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  24.55 
 
 
321 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.856441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.27 
 
 
384 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  25.47 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.95 
 
 
408 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  30.26 
 
 
391 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.7 
 
 
392 aa  52  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  30.49 
 
 
308 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>