More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0818 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  313  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1146  UspA domain protein  34.69 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.47 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.41 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.77 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.46 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  29.19 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26.32 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  30.52 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  30.52 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  33.12 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.94 
 
 		 290 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  30.41 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.08 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  28.66 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  33.55 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  31.13 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  30.13 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  30.61 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.78 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  32.7 
 
 		 277 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  35.37 
 
 		 306 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.94 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  35 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  31.54 
 
 		 296 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  34.72 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  34.38 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  27.89 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.82 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.79 
 
 		 180 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  31.54 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.72 
 
 		 300 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  33.1 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.69 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.97 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.25 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.79 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  31.72 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.64 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.87 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  29.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.69 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  29.49 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  43.55 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.14 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  31.72 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.26 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.56 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.68 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  32 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  27.89 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  28.08 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.77 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  28.08 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 297 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.03 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.72 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  30.56 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.25 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.86 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.05 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.76 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>