More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0814 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  44.35 
 
 		 281 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  39.15 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.79 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  38.26 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  36.61 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  38.05 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  36.74 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.36 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  35.74 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  37.78 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  37.78 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  36.89 
 
 		 254 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  37.78 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.08 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  32.17 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  34.44 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.8 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.8 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.38 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.4 
 
 		 265 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  33.63 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30.16 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.82 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.8 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  34.76 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.91 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  31.47 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  32.22 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.89 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.63 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 		 748 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.19 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.59 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.39 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 285 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.32 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.74 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.29 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.74 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.74 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.76 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  30.14 
 
 		 244 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.84 
 
 		 250 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>