282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0757 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  32.97 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  30.92 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  30.74 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.49 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  30.35 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  29.43 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  29.86 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.69 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  27.89 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.24 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  32.46 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  29.48 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.96 
 
 		 322 aa  95.5  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.28 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.85 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  28.92 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.39 
 
 		 322 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  28.85 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  28.84 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  29.71 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  38.26 
 
 		 325 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  28.46 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  28.09 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.88 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 343 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  28.52 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.81 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  25.08 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.17 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  30.61 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  39.09 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  25.19 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  26.62 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  30.61 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  28.44 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  32.46 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.85 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  28.5 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  25.37 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  25.37 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  29.59 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  28.16 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  26.75 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  24.16 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  32.76 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  25.37 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  26.85 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  35.25 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  25.98 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  24.11 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  36.73 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  31.62 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  27.55 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  31.37 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  34.69 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  24.55 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  23.04 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  34.95 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  34.95 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  34.95 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2795  hypothetical protein  36.08 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2888  hypothetical protein  30.88 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2702  hypothetical protein  34.69 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>