More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0748 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
146 aa  303  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  52.34 
 
 
211 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  54.47 
 
 
235 aa  141  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  51.18 
 
 
206 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  52.63 
 
 
195 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  52.71 
 
 
207 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  56.52 
 
 
174 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  56.64 
 
 
191 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 
280 aa  133  6e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  47.37 
 
 
217 aa  134  6e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  55.65 
 
 
202 aa  131  2e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  53.23 
 
 
188 aa  131  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  52.94 
 
 
228 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  51.18 
 
 
216 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 
196 aa  130  7e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  54.92 
 
 
251 aa  130  8e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  52.5 
 
 
199 aa  129  1e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  50.39 
 
 
261 aa  129  1e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  48.85 
 
 
199 aa  129  2e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  54.46 
 
 
258 aa  127  5e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  52.34 
 
 
260 aa  125  1e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  44.14 
 
 
244 aa  126  1e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  49.18 
 
 
202 aa  126  1e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 
206 aa  125  1e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  50.37 
 
 
198 aa  125  2e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  48.44 
 
 
243 aa  124  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  49.22 
 
 
237 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  55.46 
 
 
282 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  51.91 
 
 
300 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  51.91 
 
 
292 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  58.65 
 
 
201 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 
251 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 
251 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 
251 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  48.03 
 
 
329 aa  123  8e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  48.06 
 
 
239 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  55.45 
 
 
242 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  48.12 
 
 
249 aa  123  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  50.77 
 
 
209 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  48.06 
 
 
239 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  48.06 
 
 
239 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  47.66 
 
 
189 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  51.72 
 
 
226 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  48.89 
 
 
260 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  48.06 
 
 
239 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  51.33 
 
 
217 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  57.28 
 
 
197 aa  121  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  57.28 
 
 
218 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
209 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
209 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  51.26 
 
 
442 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  48.82 
 
 
247 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  52.68 
 
 
203 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  54.21 
 
 
197 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.15 
 
 
438 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  44.63 
 
 
233 aa  120  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 
204 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 
305 aa  119  1e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  46.03 
 
 
273 aa  119  1e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  53.28 
 
 
198 aa  119  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  2.86118e-10 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  46.03 
 
 
203 aa  119  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 
209 aa  119  2e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  48.48 
 
 
204 aa  118  2e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  55.34 
 
 
224 aa  118  2e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  51.16 
 
 
196 aa  119  2e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 
208 aa  119  2e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  52.14 
 
 
218 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 
326 aa  117  4e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  48 
 
 
245 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  46.03 
 
 
204 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  51.75 
 
 
216 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  48.28 
 
 
217 aa  117  8e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  51.75 
 
 
221 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 
245 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  41.61 
 
 
283 aa  116  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  45.83 
 
 
261 aa  116  1e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  2.65036e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  45 
 
 
261 aa  115  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  52.1 
 
 
258 aa  115  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  44.53 
 
 
200 aa  115  1e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  49.17 
 
 
291 aa  115  2e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  50.43 
 
 
212 aa  115  2e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  45.74 
 
 
234 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 
261 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  45 
 
 
261 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  44.17 
 
 
259 aa  114  4e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 
295 aa  113  7e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  44.17 
 
 
261 aa  113  8e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  48.28 
 
 
299 aa  113  9e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 
261 aa  112  1e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  44.17 
 
 
261 aa  112  1e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  44.17 
 
 
261 aa  113  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.33422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  44.17 
 
 
261 aa  112  1e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  45.16 
 
 
332 aa  112  2e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 
362 aa  112  2e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 
300 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  46.49 
 
 
299 aa  111  4e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 
208 aa  111  4e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  42.65 
 
 
281 aa  111  4e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.00876e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  47.69 
 
 
281 aa  110  4e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  46.55 
 
 
362 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>