More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0730 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  44.41 
 
 
885 aa  668  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 
901 aa  678  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
861 aa  637  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  45.01 
 
 
875 aa  708  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
861 aa  636  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.84 
 
 
859 aa  736  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 
878 aa  676  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  43.7 
 
 
863 aa  704  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 
855 aa  655  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  46.84 
 
 
872 aa  788  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 
871 aa  687  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.72 
 
 
869 aa  757  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  49.25 
 
 
823 aa  728  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 
855 aa  657  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 
857 aa  707  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  45.01 
 
 
872 aa  689  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.84 
 
 
910 aa  704  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
862 aa  638  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
887 aa  723  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 
888 aa  656  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
859 aa  646  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 
890 aa  637  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
856 aa  637  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  8.30859e-12 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
853 aa  696  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  45.5 
 
 
882 aa  695  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  44.11 
 
 
854 aa  643  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  42.45 
 
 
855 aa  650  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 
837 aa  763  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  50.85 
 
 
882 aa  746  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 
856 aa  649  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 
910 aa  706  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
889 aa  1817  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.1 
 
 
868 aa  695  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.77149e-05  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  48.71 
 
 
882 aa  715  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 
872 aa  650  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.82 
 
 
856 aa  637  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.87 
 
 
895 aa  651  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  43.36 
 
 
855 aa  656  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 
883 aa  655  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  5.82755e-10 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 
855 aa  638  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 
868 aa  740  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 
872 aa  673  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 
881 aa  662  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
855 aa  680  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 
858 aa  705  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 
862 aa  659  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  49.14 
 
 
872 aa  850  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 
870 aa  758  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
903 aa  649  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 
861 aa  637  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  48.97 
 
 
870 aa  808  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  45.09 
 
 
872 aa  716  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.38 
 
 
872 aa  673  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 
857 aa  655  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  6.09956e-10 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.28 
 
 
882 aa  676  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 
874 aa  667  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 
905 aa  677  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 
880 aa  650  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.38 
 
 
867 aa  743  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  47.02 
 
 
932 aa  782  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 
928 aa  660  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  48.52 
 
 
881 aa  814  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 
853 aa  646  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 
857 aa  648  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  43.93 
 
 
910 aa  695  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  50.86 
 
 
870 aa  880  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01093e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  47.43 
 
 
898 aa  723  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  43.09 
 
 
859 aa  651  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 
853 aa  644  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  45.75 
 
 
880 aa  728  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  45 
 
 
903 aa  679  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 
865 aa  675  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  45.7 
 
 
900 aa  742  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.81 
 
 
896 aa  699  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  44.48 
 
 
897 aa  709  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  45.29 
 
 
854 aa  668  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 
872 aa  669  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
863 aa  645  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 
860 aa  670  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 
855 aa  652  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 
862 aa  706  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  43.17 
 
 
858 aa  722  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 
869 aa  676  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  43.05 
 
 
858 aa  709  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  52.11 
 
 
871 aa  881  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  43.59 
 
 
857 aa  648  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 
891 aa  670  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 
894 aa  649  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 
873 aa  672  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 
854 aa  656  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  44.19 
 
 
891 aa  724  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
828 aa  662  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  44.89 
 
 
897 aa  641  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  42.22 
 
 
893 aa  648  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
886 aa  671  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
860 aa  689  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
854 aa  637  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 
863 aa  676  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 
855 aa  669  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  52.44 
 
 
882 aa  741  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>