More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0722 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  47.83 
 
 
284 aa  255  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  47.66 
 
 
285 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  43.63 
 
 
287 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  41.6 
 
 
296 aa  238  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  43.24 
 
 
287 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  47.43 
 
 
284 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  47.84 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  43.38 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  42.91 
 
 
420 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  42.74 
 
 
433 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  40.49 
 
 
420 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  40.08 
 
 
447 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  43.5 
 
 
439 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  39.76 
 
 
434 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  40.27 
 
 
259 aa  196  3e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.46 
 
 
434 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  39.39 
 
 
273 aa  195  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.23 
 
 
435 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 
464 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  37.55 
 
 
464 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  39.76 
 
 
443 aa  189  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  36.48 
 
 
417 aa  188  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  38.13 
 
 
483 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  36.22 
 
 
295 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  38.68 
 
 
490 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  35.83 
 
 
295 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  35.83 
 
 
295 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  35.83 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  39.38 
 
 
421 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 
295 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  34.69 
 
 
445 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
426 aa  185  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  34.69 
 
 
445 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.36 
 
 
430 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  39.31 
 
 
461 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.15 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  37.05 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.77 
 
 
295 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  35.8 
 
 
468 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  36.99 
 
 
425 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  39.21 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  35.46 
 
 
445 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  34.91 
 
 
309 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  36.67 
 
 
418 aa  181  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  35.71 
 
 
467 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  35.51 
 
 
432 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  36.43 
 
 
295 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 
435 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  36.65 
 
 
311 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  37.12 
 
 
434 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  40.45 
 
 
425 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  36.15 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.84 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  37.69 
 
 
298 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  34.55 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.78 
 
 
465 aa  178  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  36.4 
 
 
436 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  36.4 
 
 
436 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  36.4 
 
 
436 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  35.74 
 
 
422 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.2 
 
 
447 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  36.9 
 
 
477 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  38.98 
 
 
537 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  35.95 
 
 
443 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
279 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  37.89 
 
 
455 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
439 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  36.03 
 
 
289 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  36 
 
 
432 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
444 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  38.21 
 
 
427 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  38.25 
 
 
455 aa  175  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  35.57 
 
 
429 aa  175  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  35.93 
 
 
431 aa  175  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
457 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  34.98 
 
 
433 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  35.97 
 
 
442 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  36.24 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  39.06 
 
 
420 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  34.35 
 
 
487 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  34.24 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  33.72 
 
 
311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  36.82 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  38.68 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  36.9 
 
 
448 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3902  CBS domain containing protein  36.18 
 
 
425 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  36.65 
 
 
465 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  36.69 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>