186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0638 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  696    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  43.39 
 
 
394 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  36.67 
 
 
356 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  34.12 
 
 
350 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  34.22 
 
 
350 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  37 
 
 
354 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  36.29 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 
345 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  36.3 
 
 
339 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  30.51 
 
 
427 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  30.06 
 
 
415 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  30.46 
 
 
415 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30.43 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  32.96 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  29.43 
 
 
305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 
349 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  32.59 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  32.08 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  31.41 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.37 
 
 
307 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 
443 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.37 
 
 
307 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.41 
 
 
296 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 
305 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  31.03 
 
 
415 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  28.68 
 
 
426 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  32.32 
 
 
360 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
346 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.63 
 
 
307 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.92 
 
 
306 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.66 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.89 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  30.94 
 
 
307 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.32 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  30.82 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  29.7 
 
 
330 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.39 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.86 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.95 
 
 
306 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.96 
 
 
308 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.31 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.11 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 
303 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.76 
 
 
310 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.07 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  25.75 
 
 
304 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  30.26 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  26.98 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  30 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  30.68 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  31.6 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  27.48 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  29.86 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  28.47 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  22.62 
 
 
2798 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  27.27 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
307 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  38.05 
 
 
260 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  26.79 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  37.17 
 
 
260 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  26.35 
 
 
261 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  26.22 
 
 
261 aa  59.7  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  23.93 
 
 
266 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  36.36 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.47 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  36.28 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  34.78 
 
 
119 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  36.28 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  35.45 
 
 
260 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.68 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.68 
 
 
266 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  38 
 
 
121 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  26.19 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  36.62 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.68 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  34.45 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  34.55 
 
 
255 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.71 
 
 
309 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  36.84 
 
 
121 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  29.55 
 
 
262 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  29.55 
 
 
262 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  51.61 
 
 
269 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  41.03 
 
 
260 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>