More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0618 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0618  response regulator receiver protein  100 
 
 		 157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  56.06 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1352  response regulator receiver protein  57.48 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00001959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  53.12 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0632  response regulator receiver protein  52.27 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  49.62 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1361  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0173  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0314  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0234873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0313  response regulator receiver protein  49.23 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0254543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1351  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000171187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0327  response regulator receiver domain-containing protein  48.03 
 
 		 142 aa  117  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 		 408 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0657  response regulator receiver protein  49.61 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.771795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1991  response regulator receiver protein  50 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 403 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0620  response regulator receiver protein  47.66 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1566  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0692  response regulator receiver domain-containing protein  40.3 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000176776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1769  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 374 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 451 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0695  response regulator receiver domain-containing protein  40.94 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.396926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0407  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627834  normal  0.12665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1341  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 301 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1362  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  39.07 
 
 		 411 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3765  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 463 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 		 494 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 490 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3471  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 489 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 453 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.54 
 
 		 489 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.54 
 
 		 489 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2269  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.740525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0150  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 457 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2741  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 474 aa  97.4  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0363909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1772  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0018  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 135 aa  97.1  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000218096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0965  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 462 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 688 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2346  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0816  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.76 
 
 		 470 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 382 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2914  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 459 aa  94.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  36.84 
 
 		 516 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0404  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 151 aa  94  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 406 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 343 aa  94  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0710  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 456 aa  94  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 224 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.4 
 
 		 453 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 508 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 224 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2035  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 		 441 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 223 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4497  transcriptional regulatory protein ZraR  37.5 
 
 		 441 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000279415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 470 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4238  transcriptional regulatory protein ZraR  37.5 
 
 		 441 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.020936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4549  transcriptional regulatory protein ZraR  37.5 
 
 		 441 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000369022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4454  transcriptional regulatory protein ZraR  37.5 
 
 		 441 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209341  hitchhiker  0.000519331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  37.1 
 
 		 458 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 454 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.19 
 
 		 224 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.31 
 
 		 452 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 413 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  39.25 
 
 		 127 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  36.22 
 
 		 457 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 471 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 498 aa  91.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03881  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ZraS: response regulator/sigma54 interaction protein  37.5 
 
 		 441 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03834  hypothetical protein  37.5 
 
 		 441 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 513 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0636  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.621219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4021  transcriptional regulatory protein ZraR  37.5 
 
 		 441 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0128092  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5475  transcriptional regulatory protein ZraR  37.5 
 
 		 441 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 266 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1986  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.64 
 
 		 457 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.546437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0633  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.546392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  31.45 
 
 		 264 aa  90.9  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 387 aa  90.9  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  39.82 
 
 		 441 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.11324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.4 
 
 		 461 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  37.4 
 
 		 461 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  37.4 
 
 		 461 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>