More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0605 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  58.14 
 
 		 541 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  58.38 
 
 		 531 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 579 aa  1198    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  57.67 
 
 		 531 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  56.19 
 
 		 531 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  55.54 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  56.4 
 
 		 532 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  55.72 
 
 		 533 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  55.29 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  56.05 
 
 		 535 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  55.87 
 
 		 535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 		 535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  52.68 
 
 		 539 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  55.84 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  54.61 
 
 		 533 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  54.24 
 
 		 535 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  51.3 
 
 		 531 aa  551  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  56.03 
 
 		 527 aa  549  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  51.02 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  52.78 
 
 		 533 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  51.58 
 
 		 534 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  51.76 
 
 		 542 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  52.67 
 
 		 541 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  51.21 
 
 		 534 aa  528  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  50.55 
 
 		 539 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  51.2 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  52.95 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  52.95 
 
 		 538 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  53.22 
 
 		 529 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 		 531 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  50.65 
 
 		 533 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  50.72 
 
 		 555 aa  528  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  52.2 
 
 		 534 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  51.74 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  53.22 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  51.28 
 
 		 538 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  51.28 
 
 		 538 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  51.99 
 
 		 535 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  54.11 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  51.65 
 
 		 534 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  52.2 
 
 		 534 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  53.12 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  50.38 
 
 		 561 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  50.64 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  50.27 
 
 		 538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  51.1 
 
 		 538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  50.37 
 
 		 537 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  50.56 
 
 		 537 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  51.1 
 
 		 538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  50.37 
 
 		 537 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  54.02 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  49.81 
 
 		 537 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  50.92 
 
 		 538 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  49.07 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  49.81 
 
 		 537 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  50.37 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  50.76 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  51.34 
 
 		 541 aa  512  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  49.25 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  49.81 
 
 		 537 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  48.42 
 
 		 531 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  49.63 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  49.35 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  50.57 
 
 		 533 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  48.52 
 
 		 537 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  50.76 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  49.73 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  49.35 
 
 		 536 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  49.72 
 
 		 535 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  48.67 
 
 		 543 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  51.42 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  51.42 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 		 532 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  50.56 
 
 		 537 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  48.91 
 
 		 536 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  47.99 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 532 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 533 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  48.98 
 
 		 537 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  49.72 
 
 		 542 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  49.81 
 
 		 528 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  50.85 
 
 		 533 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  49.06 
 
 		 534 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  49.91 
 
 		 532 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 		 545 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 528 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  51.38 
 
 		 528 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>