46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0592 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  180  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  63.64 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  51.69 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  51.69 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  47.78 
 
 		 177 aa  87  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  47.78 
 
 		 177 aa  87  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  53.33 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  46.74 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  46.24 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  61.45 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  48.1 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  41.86 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  45.05 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  49.3 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  41.05 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  47.83 
 
 		 232 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  49.38 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  45.56 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  47.83 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  40.96 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  40.96 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  55.68 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  38.2 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  52.27 
 
 		 187 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  54.22 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  46.32 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  34.07 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  34.94 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  46.15 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  37.35 
 
 		 163 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  50.65 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  53.57 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  43.33 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  47.56 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  42.22 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  44.94 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  46.15 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  39.56 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  32.18 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  35.16 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  43.53 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  51.06 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  36.59 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5417  membrane protein  37.5 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.711209  normal  0.0915439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>