More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0550 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  54.9 
 
 		 291 aa  295  8e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  50.56 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  50.72 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  52.01 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  52.59 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  50.94 
 
 		 394 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  49.63 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.6 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  49.04 
 
 		 278 aa  255  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  46.89 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  47.47 
 
 		 397 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  43.84 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  47.89 
 
 		 376 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 		 393 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  46.98 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  45.39 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 394 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  48.12 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 		 385 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  48.77 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  53.41 
 
 		 345 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  47 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  46.98 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  47 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  46.91 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  47 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  46.98 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  52.76 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  45.96 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 		 277 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  46.52 
 
 		 282 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  48.16 
 
 		 280 aa  235  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 277 aa  235  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  48.53 
 
 		 278 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 		 283 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 		 278 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  46.12 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 		 277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  46.54 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  45.31 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.74 
 
 		 279 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  46.12 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  49.63 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 407 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 283 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.23 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  46.28 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 		 331 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  47.74 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  43.21 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>