237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0533 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 		 589 aa  1207    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  55.15 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  48.21 
 
 		 598 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  48.21 
 
 		 598 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  48.71 
 
 		 607 aa  521  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  45.97 
 
 		 620 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  45.8 
 
 		 620 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.94 
 
 		 620 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  44.29 
 
 		 597 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.38 
 
 		 616 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.33 
 
 		 620 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.77 
 
 		 625 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  43.84 
 
 		 617 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  43.91 
 
 		 616 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  44.46 
 
 		 614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.77 
 
 		 625 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.06 
 
 		 615 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  42.02 
 
 		 619 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  43.64 
 
 		 622 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  43.12 
 
 		 617 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  43.49 
 
 		 664 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.63 
 
 		 616 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.21 
 
 		 615 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  43.15 
 
 		 634 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  42.71 
 
 		 632 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  43.05 
 
 		 610 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.21 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  44.25 
 
 		 601 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  42.54 
 
 		 626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.88 
 
 		 626 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.88 
 
 		 627 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.54 
 
 		 625 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.14 
 
 		 573 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.02 
 
 		 638 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.27 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  40.59 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  42.34 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  40.48 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  41.8 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.97 
 
 		 606 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.31 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  41.1 
 
 		 620 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  39.14 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  38.06 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.21 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.21 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.76 
 
 		 589 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  37.61 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.94 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  36.63 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  39.9 
 
 		 611 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  36.16 
 
 		 566 aa  395  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  37.05 
 
 		 571 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.56 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.18 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  36.46 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  36.11 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  36.11 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  33.51 
 
 		 584 aa  340  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  36.95 
 
 		 601 aa  326  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.47 
 
 		 590 aa  317  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.75 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.66 
 
 		 597 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  34.59 
 
 		 577 aa  282  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  28.52 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  26.14 
 
 		 595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.16 
 
 		 582 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.81 
 
 		 586 aa  214  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  29.93 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0909  oligoendopeptidase F  28.98 
 
 		 608 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  28.84 
 
 		 601 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  27.8 
 
 		 599 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  27.29 
 
 		 619 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  27.62 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  26.69 
 
 		 594 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  28.26 
 
 		 600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  29.12 
 
 		 608 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  29.51 
 
 		 608 aa  196  1e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  28.79 
 
 		 608 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  25.81 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  28.79 
 
 		 608 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  28.45 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0768  oligoendopeptidase F  28.5 
 
 		 604 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 608 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  28.28 
 
 		 608 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  28.79 
 
 		 608 aa  193  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  28.62 
 
 		 608 aa  193  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1623  oligoendopeptidase F  27.77 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  30.28 
 
 		 603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  26.09 
 
 		 597 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3050  oligoendopeptidase F  31.17 
 
 		 599 aa  190  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.17 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.9 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  27.89 
 
 		 597 aa  188  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  27.41 
 
 		 606 aa  186  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  26.84 
 
 		 600 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2452  oligopeptidase F  26.87 
 
 		 602 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0442  oligopeptidase F  25.42 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>