More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0513 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 617 aa  1251    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  37.99 
 
 		 459 aa  280  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 		 470 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  37.17 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  37.14 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  38.58 
 
 		 461 aa  272  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 471 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 		 466 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  34.13 
 
 		 463 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 470 aa  266  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.51 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.1 
 
 		 472 aa  261  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1354  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.14 
 
 		 472 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47654  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 471 aa  256  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  34.79 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  34.36 
 
 		 455 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.73 
 
 		 456 aa  253  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.56 
 
 		 478 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.73 
 
 		 471 aa  249  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.39 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.97 
 
 		 478 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  33.82 
 
 		 478 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2606  beta-lactamase domain protein  34.11 
 
 		 444 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0866757 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.76 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  33.87 
 
 		 448 aa  239  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 		 469 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 467 aa  234  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1892  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 453 aa  233  9e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0875078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 470 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  34.2 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  34.3 
 
 		 456 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 		 466 aa  225  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 476 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4226  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 		 476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2086  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.472502  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  30.55 
 
 		 464 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 		 484 aa  200  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2225  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 470 aa  200  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  32.83 
 
 		 479 aa  200  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0980  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 455 aa  197  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.64 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.77 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2578  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 471 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010585  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 466 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5835  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 		 450 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 476 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2435  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 442 aa  187  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4014  beta-lactamase-like protein  32.25 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4088  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4244  beta-lactamase domain-containing protein  32.25 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0108  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 454 aa  183  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0421  beta-lactamase-like  29.3 
 
 		 450 aa  183  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21680  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.48 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2038  beta-lactamase domain protein  31.74 
 
 		 451 aa  181  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0124329  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.55 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0208  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  33.7 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  30.43 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 462 aa  170  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3839  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 469 aa  161  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1900  metallo-beta-lactamase family protein  29.86 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3632  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 488 aa  144  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3957  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 489 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1014  beta-lactamase domain protein  27.58 
 
 		 454 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.532589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 246 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  38.89 
 
 		 251 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.96 
 
 		 243 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 244 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  36.79 
 
 		 244 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 		 378 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.21 
 
 		 354 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 213 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 382 aa  109  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 243 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 243 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 243 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  31.28 
 
 		 391 aa  107  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 		 376 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 375 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>