205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0504 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 132 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  37.4 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  37.98 
 
 		 133 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  51.43 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  35.77 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  36.59 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  37.23 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  35.21 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  34.93 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  34.93 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  36.36 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  34.56 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  33.33 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  33.57 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  32.19 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  33.57 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  33.57 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  32.87 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  34.81 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1863  Ros/MucR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  34 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  30.07 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  40.91 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  40.91 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  31.85 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  28.57 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  46.27 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  42.03 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  46.27 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  28.57 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  34.09 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  46.27 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  37.5 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  31.86 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  43.94 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  31.86 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  26.28 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  37.93 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  42.42 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  42.42 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  28.26 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  36.78 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  27.61 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  26.87 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  39.39 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  40.91 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>