More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0424 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 640 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 636 aa  886    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 634 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 635 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 638 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 636 aa  898    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 638 aa  688    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 640 aa  657    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 637 aa  641    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 636 aa  674    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 643 aa  682    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 639 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 639 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 639 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 639 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 639 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 637 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 647 aa  768    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 640 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 636 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 		 638 aa  652    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 635 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 646 aa  862    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 644 aa  798    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 644 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 635 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 639 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 638 aa  859    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 635 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 644 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 		 645 aa  892    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  62.38 
 
 		 644 aa  826    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 639 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 637 aa  706    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 640 aa  647    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 		 649 aa  796    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 633 aa  678    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 603 aa  635    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 		 645 aa  899    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 640 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 669 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 635 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 631 aa  661    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 634 aa  724    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 640 aa  651    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 644 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 636 aa  897    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 640 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 635 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 643 aa  690    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 633 aa  644    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 644 aa  761    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 641 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 638 aa  662    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 635 aa  686    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 644 aa  1322    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 648 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 643 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 639 aa  697    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 635 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 636 aa  872    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 634 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 644 aa  797    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 642 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 602 aa  631  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 637 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 602 aa  628  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 638 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 605 aa  631  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 636 aa  630  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 635 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 640 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 640 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 583 aa  630  1e-179  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 640 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 643 aa  628  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 637 aa  626  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 642 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 602 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 640 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 635 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 639 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 639 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 635 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 659 aa  624  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 642 aa  625  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 582 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 638 aa  621  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2053  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.22159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>