More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0398 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 686 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.6 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  49.26 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  46.81 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  46.73 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.54 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 686 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  43.22 
 
 		 197 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 671 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.62 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  48.42 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  44.79 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  46.46 
 
 		 901 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 705 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  48.19 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  43.92 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  45.73 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.37 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  42.93 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  44.12 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.05 
 
 		 703 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 707 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  42.23 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.72 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.67 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.13 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  41.95 
 
 		 688 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.09 
 
 		 688 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  42.71 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  42.13 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  42.27 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  46.39 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  47.96 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  40 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  44.57 
 
 		 295 aa  154  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 707 aa  154  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  41.95 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  48.95 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.69 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.23 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  41.58 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  43 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  42.56 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  45.76 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  44.02 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  41.04 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  41.41 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  45.64 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  46.84 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.32 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  38.22 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  44.66 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  47.76 
 
 		 662 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  44.66 
 
 		 234 aa  148  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  44.56 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  44.67 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.51 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  43.1 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  43.68 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  44.16 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  42.53 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>