232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0357 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1929  ThiJ/PfpI domain protein  60.46 
 
 		 527 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1905  ThiJ/PfpI domain protein  60.46 
 
 		 521 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0357  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 500 aa  1031    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1852  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.1 
 
 		 312 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4703  ThiJ/PfpI domain protein  55.97 
 
 		 288 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0384  ThiJ/PfpI domain protein  53.38 
 
 		 308 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00197683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2868  ThiJ/PfpI domain protein  53.17 
 
 		 273 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.653619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0819  hypothetical protein  51.71 
 
 		 288 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0139271  unclonable  0.00000805455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2862  ThiJ/PfpI domain protein  34.03 
 
 		 191 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5019  ThiJ/PfpI  31.03 
 
 		 200 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.729163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0828  hypothetical protein  25.54 
 
 		 254 aa  93.2  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.775057  unclonable  0.0000112363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  28.95 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  25.93 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  25.55 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  26.86 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  25 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  29.1 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.83 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0958  ThiJ/PfpI domain protein  24.81 
 
 		 225 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  25.38 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  30.15 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  27.07 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  27.23 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  28.57 
 
 		 173 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  23.37 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  25.86 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.21 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  25.12 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  29.19 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  26.06 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  24.23 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  30.53 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  26.42 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  25.38 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  27.78 
 
 		 230 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  23.71 
 
 		 182 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.12 
 
 		 228 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  26.32 
 
 		 193 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  28.18 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 		 228 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.52 
 
 		 231 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  29.63 
 
 		 182 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  30 
 
 		 171 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  30 
 
 		 171 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  28.87 
 
 		 183 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  28.51 
 
 		 233 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  28.8 
 
 		 181 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  24.53 
 
 		 232 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.02 
 
 		 227 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.84 
 
 		 284 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  24.45 
 
 		 228 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.89 
 
 		 229 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  24.86 
 
 		 250 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  27.27 
 
 		 186 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  25.82 
 
 		 279 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  24.55 
 
 		 227 aa  53.9  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  23.12 
 
 		 182 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  23.97 
 
 		 229 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.52 
 
 		 225 aa  53.5  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  28.02 
 
 		 228 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  23.11 
 
 		 233 aa  53.5  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  30.88 
 
 		 226 aa  53.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  23.4 
 
 		 225 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  29.33 
 
 		 267 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  26.53 
 
 		 204 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  24.52 
 
 		 225 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  28.04 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  26.44 
 
 		 187 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.11 
 
 		 231 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  22.5 
 
 		 179 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  25.86 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  24.53 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  23.88 
 
 		 227 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  25.86 
 
 		 230 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  26.01 
 
 		 172 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  28.24 
 
 		 172 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  24.15 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  25.79 
 
 		 187 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.46 
 
 		 233 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  28.96 
 
 		 226 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.97 
 
 		 230 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.67 
 
 		 227 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  23.02 
 
 		 223 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.62 
 
 		 228 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  25.41 
 
 		 220 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  24.54 
 
 		 250 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  26.7 
 
 		 231 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  26.18 
 
 		 177 aa  51.6  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.53 
 
 		 230 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  24.54 
 
 		 250 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.24 
 
 		 228 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.53 
 
 		 230 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  47.95 
 
 		 195 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  26.02 
 
 		 229 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3480  ThiJ/PfpI  34.29 
 
 		 241 aa  50.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.782484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.53 
 
 		 232 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  25.51 
 
 		 180 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  47.95 
 
 		 192 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.53 
 
 		 230 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>