More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0352 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.67 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.57 
 
 		 153 aa  87.8  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.97 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.65 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.18 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  30.86 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.03 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.48 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.79 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.33 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.11 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.56 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.12 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  30.41 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  30.41 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.56 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  27.85 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.52 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.93 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  31.79 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  31.61 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.74 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.38 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26.85 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.72 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.72 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.87 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.41 
 
 		 320 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  29.86 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  32.03 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  29.86 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  30.87 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  30.07 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  27.89 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.47 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.33 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.29 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.08 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.08 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.38 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.95 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  25.33 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.63 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.27 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.07 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.94 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  27.27 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.41 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  25.45 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  27.85 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  29.17 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  30.67 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  29.94 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  27.08 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  30.52 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.1 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  29.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.1 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30.36 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  30.99 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  22.92 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  28.97 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  24.07 
 
 		 515 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.7 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.17 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>