More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0312 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  100 
 
 		 326 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  51.13 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.58 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  38.69 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  40.9 
 
 		 368 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  40.9 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 366 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  37.5 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  36.25 
 
 		 616 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  34.47 
 
 		 603 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.17 
 
 		 609 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 		 339 aa  165  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  33.54 
 
 		 603 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.12 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 381 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 335 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.97 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3979  ABC transporter permease  31.75 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  37.4 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 407 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  27.76 
 
 		 663 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5835  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825187  hitchhiker  0.0031354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5694  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  29.55 
 
 		 646 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 562 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.46 
 
 		 646 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  29.4 
 
 		 648 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  29.81 
 
 		 643 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.01 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.98 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2933  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5535  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  hitchhiker  0.00000782274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  30.38 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 350 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 357 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 633 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30.89 
 
 		 463 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5974  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  29.86 
 
 		 678 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.87 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 355 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  32.71 
 
 		 832 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3011  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>