More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0246 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  802    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  43.43 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  44.69 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  43.6 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  42.17 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  42.38 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  42 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  42.38 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  42.38 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  33.42 
 
 		 375 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  41.1 
 
 		 323 aa  199  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  34.86 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  34.5 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  33.51 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  40.07 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  38.28 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  34.23 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  32.36 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  34.46 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  35.77 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  33.69 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  35.17 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  37.46 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  39.93 
 
 		 261 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  39.93 
 
 		 261 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  37.13 
 
 		 319 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  32.9 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  31.25 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  33.62 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  43.7 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  37.94 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  45.99 
 
 		 328 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  32.57 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  31.28 
 
 		 392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  32.37 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  30.63 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  28.42 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  33.77 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  36.13 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  35.9 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  39.64 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  31.76 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.88 
 
 		 618 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  31.45 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  33.88 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  31.02 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  31.8 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  28.57 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  31.8 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  29.54 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  29.17 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  29 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  29.2 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  30.53 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  25 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  27.52 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  24.09 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  23.44 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  31.58 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  49.12 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  21.32 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 131 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.11 
 
 		 271 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  52 
 
 		 598 aa  53.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.12 
 
 		 505 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  44.9 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  41.25 
 
 		 635 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2218  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S subunit  47.27 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  25.4 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1033  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.68 
 
 		 74 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1303200000000001e-18  hitchhiker  0.00000903571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  26.81 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  26.89 
 
 		 282 aa  51.2  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 133 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.356069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3944  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 292 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 55 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000062189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  42.25 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0274  hypothetical protein  40.82 
 
 		 61 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 56 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421595  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.22 
 
 		 62 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1753  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.55 
 
 		 55 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000316895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  33.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1124  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.9 
 
 		 57 aa  49.7  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2708  ferredoxin family protein  44.68 
 
 		 56 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0668  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 132 aa  49.7  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.75 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.48 
 
 		 128 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1835  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.75 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0815  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.6 
 
 		 85 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  46.94 
 
 		 596 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.89 
 
 		 57 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00607284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  41.38 
 
 		 636 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  40.98 
 
 		 639 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  35.29 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>