37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0244 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  223  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  29.73 
 
 
116 aa  60.1  9e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  36.46 
 
 
105 aa  58.2  4e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  30.53 
 
 
98 aa  57.4  7e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.61356e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  29.36 
 
 
108 aa  57  9e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.49489e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  25.53 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  55.1  3e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  29.17 
 
 
108 aa  52.4  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  35.05 
 
 
104 aa  52  3e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  26.04 
 
 
109 aa  51.2  4e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  32.63 
 
 
106 aa  49.7  1e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  29.7 
 
 
106 aa  48.9  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  32.32 
 
 
111 aa  49.3  2e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  23.91 
 
 
104 aa  48.9  2e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  28.87 
 
 
108 aa  48.9  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  29.21 
 
 
108 aa  48.1  4e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  31.19 
 
 
105 aa  47.8  5e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  29.27 
 
 
108 aa  47  8e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25.23 
 
 
159 aa  47  8e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  24.14 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  25 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0332  hypothetical protein  28.42 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  35.42 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  28.4 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  31.11 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  26.04 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  22.11 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6060  hypothetical protein  28.28 
 
 
237 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  23.71 
 
 
107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2894  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0388565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2587  hypothetical protein  26.13 
 
 
121 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  23.71 
 
 
107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  23.4 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  22.11 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1244  hypothetical protein  25 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1048  hypothetical protein  36.21 
 
 
92 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.487326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>