More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0240 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
231 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2191  hypothetical protein  33.18 
 
 
225 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  37.16 
 
 
202 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0133  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285764 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0041  quinone methlytransferase  37.33 
 
 
168 aa  89  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000105816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1711  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
208 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.12 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.73 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.89 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.46 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.21 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  30.06 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  35.58 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  35.58 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  30.77 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  30.11 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  31.9 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  38.6 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
317 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
265 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 
362 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
267 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.51 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.9 
 
 
246 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
273 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.83 
 
 
253 aa  62  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.2 
 
 
235 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
354 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.62 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.62 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.53 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.2 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  36.79 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4884  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.65 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.321775  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  32.58 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.82 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.46 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  34.51 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1444  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.71 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  36.27 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
363 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.72 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.45 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  36.13 
 
 
231 aa  58.2  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.53 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  28.65 
 
 
351 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.74 
 
 
253 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.89 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.25 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.17 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.07 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  31.32 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.78 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.34 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  35.85 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.9 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.13 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1620  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.29 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  31.71 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
283 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
328 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 
365 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>