176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0234 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0234  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000960641  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0504  MucR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000938261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0350  MucR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.705833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1525  MucR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000012221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1305  MucR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192509  normal  0.0470135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2241  MucR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000475717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2405  transcriptional regulator, MucR family  35.53 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2863  transcriptional regulator, MucR family  34.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.292208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0717  MucR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3088  transcriptional regulator, MucR family  31.94 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000560942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0908  transcriptional regulator, MucR family  38.02 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000358508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1173  transcriptional regulator, MucR family  31.25 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.2669100000000005e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2003  transcriptional regulator, MucR family  34.93 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000972284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2218  transcriptional regulator, MucR family  34.93 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166227 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2537  transcriptional regulator, MucR family  38.84 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  3.23435e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2166  transcriptional regulator, MucR family  39.37 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.913092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2292  transcriptional regulator, MucR family  36.36 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000355308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2491  MucR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000203493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0303  MucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0874  MucR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0513  transcriptional regulator, MucR family  33.58 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000475378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1281  transcriptional regulator, MucR family  34.71 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000011615  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2217  transcriptional regulator, MucR family  32.62 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1863  Ros/MucR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000224097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2010  transcriptional regulator, MucR family  32.62 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16159e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2317  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2453499999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0974  transcriptional regulator, MucR family  33.86 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0346  MucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0568381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2312  transcriptional regulator, MucR family  30.34 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000401641  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3806  MucR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000654618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2256  transcriptional regulator, MucR family  34.31 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2613  MucR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.964006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0298  MucR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1806  transcriptional regulator, MucR family  33.6 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.99566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1302  transcriptional regulator, MucR family  32.23 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  29.1 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  25.37 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  25.37 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  28.95 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  27.81 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  28.99 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  26.01 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  27.61 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3967  MucR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  38.81 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  25.93 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  36.08 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  25.55 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  27.01 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  41.54 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  25.47 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  26.09 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  40 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  41.54 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  27.74 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  29.29 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  41.54 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  37 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  26.32 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  25.95 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  27.94 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  25.37 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0295  MucR family transcriptional regulator  30 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.878488 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  26.81 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6054  MucR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  28.89 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>