252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0230 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  58.65 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  58.33 
 
 		 215 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  50.93 
 
 		 216 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  54.33 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  48.13 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  48.33 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  41.55 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  37.67 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  37.67 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  37.67 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  37.67 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  38.6 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  41.55 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  36.97 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  40.48 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  40.48 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  42.38 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  41.55 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  37.67 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  42.38 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  44.67 
 
 		 366 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  37.67 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  37.67 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  37.67 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  41.9 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  37.67 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  43.54 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  40.57 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  44.55 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  42.29 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  42.79 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  38.57 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  42.31 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  42.29 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  39.52 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  41.63 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  41.35 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  41.35 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  39.13 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  40.89 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  39.05 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0771  hemolysin III family channel protein  43 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  40.87 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  34.45 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  38.76 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  38.28 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  40.1 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  38.94 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  39.71 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  41.15 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  43.65 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  39.61 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  44.29 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  44.28 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  40.48 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  43.78 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  40 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  44.57 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  42.33 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  36.49 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  36.49 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  36.89 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  42.65 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  37.75 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  42.95 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  37.44 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  39.13 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  36.62 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  33.33 
 
 		 268 aa  131  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0117  membrane protein  33.49 
 
 		 233 aa  131  6e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  39.41 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  38.35 
 
 		 211 aa  131  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  45.18 
 
 		 262 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  36.15 
 
 		 239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  38.1 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  43.6 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  36.15 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  41.58 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>