More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0227 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 178 aa  118  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 281 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.33 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.33 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  38.33 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  38.33 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.33 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.33 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.33 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.33 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  41.06 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  44.52 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  40.38 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 179 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 169 aa  105  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.13 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  36.05 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  36.53 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 208 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 		 214 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  36.18 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  35.26 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  35.93 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.54 
 
 		 171 aa  87.8  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 181 aa  87.8  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 176 aa  84.3  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>