More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0147 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  100 
 
 		 170 aa  348  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  52.76 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  53.21 
 
 		 172 aa  174  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  48.5 
 
 		 171 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  51.19 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  50.61 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.17 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.82 
 
 		 169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  50.9 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  47.9 
 
 		 174 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  53.42 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  51.85 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  49.11 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  47.31 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  47.67 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  48.5 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  45.73 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  50.3 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  48.47 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  47.62 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  45.73 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  48.78 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.48 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  50 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  47.09 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  48.8 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  49.1 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  49.04 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  47.02 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  46.58 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  48.19 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.96 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.56 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  48.21 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  45.96 
 
 		 185 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  49.69 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  49.69 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  48.21 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  47.31 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  48.21 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.96 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  47.02 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  47.62 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  47.62 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  45.88 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  50.29 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  47.56 
 
 		 172 aa  150  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  44.64 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  44.91 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  47.24 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  45.24 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  45.24 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  46.39 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  46.39 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  47.02 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  46.99 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  46.71 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  47.31 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.43 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  50.31 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  46.67 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.88 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  46.24 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  53.02 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  46.24 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  42.26 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  44.91 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  43.98 
 
 		 169 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  46.01 
 
 		 172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  45.73 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  47.24 
 
 		 199 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  43.37 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  43.37 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  47.88 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  43.37 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  46.06 
 
 		 171 aa  144  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  44.31 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  44.12 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  43.71 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.01 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  47.65 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  47.65 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  47.24 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  44.12 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  42.6 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  46.01 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  51.22 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  44.91 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  44.91 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  44.91 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  45.83 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  46.3 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  44.17 
 
 		 169 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  43.56 
 
 		 169 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  43.56 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  45.4 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  45.4 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>