More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0142 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 432 aa  881    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  56.15 
 
 		 433 aa  481  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.65 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  52.08 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  47.14 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  47.25 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  48.76 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  49.21 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  42.99 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  44.22 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  45.15 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  45.27 
 
 		 437 aa  358  9e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  46.12 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  44.9 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  43.82 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.88 
 
 		 440 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  43.58 
 
 		 468 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  44.26 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  41.77 
 
 		 432 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  45.43 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.44 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  44.78 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  43.68 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.75 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.27 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.27 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.27 
 
 		 447 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  40.53 
 
 		 464 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  43.39 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.67 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  41.83 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.33 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  39.33 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.33 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  39.02 
 
 		 452 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40.13 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 		 472 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.27 
 
 		 463 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  38.41 
 
 		 461 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  38.08 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  37.29 
 
 		 474 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  35.92 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  34.4 
 
 		 476 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.12 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  33.75 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  32.84 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  33.79 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  33.79 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.79 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.91 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  33.79 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  33.79 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  33.79 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  33.1 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  29.75 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  22 
 
 		 481 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  23.13 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.66 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  27.14 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.1 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  28.67 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  30.11 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  33.33 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.52 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  22.06 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.14 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  31.25 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.25 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  32.38 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  22.65 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  22.36 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  21.57 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  23.2 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.83 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  28.14 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.56 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  25.39 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.14 
 
 		 362 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.56 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.11 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  34.95 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  21.94 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.57 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.97 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.67 
 
 		 470 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>