17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0116 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0116  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  196  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2833  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2650  hypothetical protein  52.38 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00012678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1566  hypothetical protein  51.19 
 
 
97 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1309  hypothetical protein  52.38 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.82918e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1604  hypothetical protein  52.38 
 
 
96 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000274269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0989  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000432022  decreased coverage  0.0038669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2014  hypothetical protein  48.81 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2018  hypothetical protein  48.81 
 
 
97 aa  87.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2048  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1830  hypothetical protein  48.81 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000442352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1932  hypothetical protein  51.76 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.700182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1864  hypothetical protein  48.24 
 
 
93 aa  84.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.215821  normal  0.0538289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0549  hypothetical protein  50.65 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1811  hypothetical protein  47.56 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697321  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1334  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.672757  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2947  hypothetical protein  38.89 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.926437  normal  0.569731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>