More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0108 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 569 aa  1162    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 		 557 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  51.23 
 
 		 566 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.09 
 
 		 585 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  51.28 
 
 		 549 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  49.55 
 
 		 559 aa  565  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  49.56 
 
 		 564 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  49.11 
 
 		 561 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.4 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.22 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.4 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.06 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  49.46 
 
 		 583 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.59 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.4 
 
 		 563 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.41 
 
 		 582 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.4 
 
 		 582 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.76 
 
 		 561 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.06 
 
 		 561 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 565 aa  554  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  49.36 
 
 		 551 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  49.82 
 
 		 539 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.55 
 
 		 561 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  46.74 
 
 		 584 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  48.45 
 
 		 573 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  47.5 
 
 		 577 aa  535  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  46.45 
 
 		 591 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 		 590 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  44.42 
 
 		 585 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  45.01 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  44.43 
 
 		 578 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  44.66 
 
 		 583 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 584 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  45.52 
 
 		 543 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  45.64 
 
 		 554 aa  475  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 		 558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 		 575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 		 549 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.62 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.39 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 560 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.13 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.41 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.42 
 
 		 562 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.22 
 
 		 554 aa  412  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  40.67 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.04 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  41.22 
 
 		 577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 		 591 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.73 
 
 		 569 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.73 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.15 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.5 
 
 		 581 aa  399  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.19 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.19 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.19 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.55 
 
 		 510 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.55 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.36 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.55 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.55 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 		 521 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.74 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 584 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  41.22 
 
 		 560 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 584 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.85 
 
 		 562 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.36 
 
 		 510 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.3 
 
 		 562 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.17 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.83 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.25 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  40.63 
 
 		 536 aa  392  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  39.75 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.36 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.48 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.29 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 		 586 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.63 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 601 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.98 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  40.43 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.29 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>