More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0068 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  57.02 
 
 
697 aa  825    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  45.56 
 
 
692 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  56.07 
 
 
697 aa  790    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  47.58 
 
 
692 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  47.49 
 
 
689 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  47.79 
 
 
691 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  51.53 
 
 
685 aa  690    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  56.85 
 
 
701 aa  802    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  47.19 
 
 
689 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  46.08 
 
 
673 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  52.05 
 
 
688 aa  711    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  56.56 
 
 
701 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  54.99 
 
 
692 aa  763    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.71 
 
 
692 aa  707    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.58 
 
 
692 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  55.64 
 
 
697 aa  801    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  50 
 
 
688 aa  672    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  50.58 
 
 
686 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  51.24 
 
 
680 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  47.49 
 
 
692 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  47.53 
 
 
673 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  53.32 
 
 
686 aa  741    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  45.15 
 
 
697 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  46.16 
 
 
690 aa  652    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  51.02 
 
 
687 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45 
 
 
697 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  45.92 
 
 
701 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  48.51 
 
 
696 aa  680    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  46.91 
 
 
690 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  46.93 
 
 
670 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  46.97 
 
 
689 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  51.59 
 
 
691 aa  732    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  46.3 
 
 
696 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  46.01 
 
 
696 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  46.19 
 
 
696 aa  643    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  50.74 
 
 
682 aa  685    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  54.01 
 
 
694 aa  784    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.32 
 
 
695 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  47.49 
 
 
695 aa  681    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  45.31 
 
 
692 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  100 
 
 
691 aa  1412    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  50.66 
 
 
679 aa  689    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  55.59 
 
 
694 aa  801    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  45.52 
 
 
692 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.17 
 
 
691 aa  642    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  45.37 
 
 
692 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.37 
 
 
692 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.26 
 
 
692 aa  634  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  44.85 
 
 
697 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  45.83 
 
 
692 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  45.37 
 
 
692 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.39 
 
 
689 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  44.59 
 
 
698 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  45.27 
 
 
692 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  45.79 
 
 
693 aa  630  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  45.27 
 
 
692 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  45.12 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.98 
 
 
692 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  45.86 
 
 
692 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  44.67 
 
 
692 aa  632  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  47.14 
 
 
692 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  46.6 
 
 
691 aa  627  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  45.01 
 
 
692 aa  628  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  44.98 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  44.74 
 
 
697 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  44.83 
 
 
692 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  44.51 
 
 
691 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  45.96 
 
 
691 aa  623  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  43.13 
 
 
699 aa  623  1e-177  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  44.64 
 
 
691 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  43.13 
 
 
699 aa  623  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  46.04 
 
 
683 aa  624  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  45.01 
 
 
694 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  45.64 
 
 
697 aa  623  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  47.3 
 
 
694 aa  618  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  44.71 
 
 
697 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  43.88 
 
 
698 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  46.74 
 
 
688 aa  618  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  43.44 
 
 
698 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  44.74 
 
 
695 aa  620  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  44.51 
 
 
707 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  47.49 
 
 
686 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  43.86 
 
 
692 aa  615  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  44.99 
 
 
697 aa  616  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  43.44 
 
 
698 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  43.44 
 
 
698 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  45.56 
 
 
691 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  43.44 
 
 
698 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  46.59 
 
 
688 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  43.44 
 
 
698 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  47.49 
 
 
683 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  43.59 
 
 
693 aa  617  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  43.44 
 
 
698 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  43.29 
 
 
698 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  44.22 
 
 
696 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  45.64 
 
 
701 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  45.49 
 
 
701 aa  615  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>