57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4036 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  73.15 
 
 		 230 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  62.04 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  59.63 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  59.63 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  59.63 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  59.63 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  53.7 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  51.15 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  40.64 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  38.68 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  34.75 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  47.06 
 
 		 129 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  28.24 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  28.04 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  29.93 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  22.4 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  30.72 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  27.15 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  26.26 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  24.4 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  30 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  27.61 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  24.87 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  25.47 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  27.34 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  27.7 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  24.69 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  25.68 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  24.24 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  24.34 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  22.75 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  28.08 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  25.31 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.65 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 288 aa  46.2  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  23.94 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  25.42 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  26.32 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  26.47 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  28.67 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  25.56 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  29.87 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 284 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 265 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1889  O-methyltransferase  32.61 
 
 		 227 aa  41.6  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>