More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3987 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  64.15 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  64.49 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  64.17 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  64.49 
 
 		 319 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  61.95 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  61.95 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  61.64 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  37.58 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  37.73 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  39.21 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  38.32 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  38.96 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  36.96 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  34.19 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  35.03 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  34.19 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.69 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  35.58 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  34.76 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  33.55 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  33.85 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.51 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  33.64 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.28 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  32.06 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.94 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.94 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.63 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  31.45 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.31 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.79 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.63 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  33.75 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  29.85 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  31.63 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  31.63 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  31.63 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  32.52 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  31.02 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.79 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.38 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  30.12 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.42 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  31.66 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  34.08 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.69 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  31.36 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.53 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 		 316 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.08 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  32.59 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  31.68 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  27.05 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  31.33 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  30.4 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  29.71 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.27 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.48 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  29.94 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  29.21 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.57 
 
 		 323 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  29.81 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  32.53 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  30.57 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.61 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  29.9 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  28.47 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.61 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  32.28 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  27.18 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  27.18 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  28.82 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  30.41 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  28.44 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.27 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  29.41 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>