17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3980 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0070  hypothetical protein  43.37 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4281  hypothetical protein  43.9 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0068  hypothetical protein  43.9 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  43.18 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0054  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.541214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0073  hypothetical protein  43.9 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  41.33 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  46.77 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0069  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0073  hypothetical protein  43.06 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000535971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0071  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  38.46 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0629  hypothetical protein  37.66 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.375966  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0629  hypothetical protein  37.66 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156939  normal  0.671447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3400  hypothetical protein  37.66 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>