More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3978 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  86.48 
 
 		 244 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  84.02 
 
 		 244 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  84.02 
 
 		 244 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  84.02 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  84.02 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  83.2 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  83.2 
 
 		 244 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  83.2 
 
 		 244 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  83.61 
 
 		 244 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  82.79 
 
 		 244 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  81.56 
 
 		 244 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  81.15 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  80.74 
 
 		 244 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  79.1 
 
 		 244 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  77.46 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  61.35 
 
 		 251 aa  321  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  56.05 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  56.05 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  52.02 
 
 		 248 aa  277  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  42.02 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  43.1 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  42.68 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.67 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  37.86 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 285 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 369 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  44.8 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.93 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.65 
 
 		 315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  38.63 
 
 		 293 aa  181  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  43.64 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  40.5 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  39.41 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.09 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  38.84 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  41.41 
 
 		 339 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  40.45 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  37.87 
 
 		 275 aa  175  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.11 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 305 aa  174  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  38.03 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  38.18 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40.17 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  41.59 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.17 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  38.79 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  39.58 
 
 		 512 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.25 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.83 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  38.39 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.57 
 
 		 309 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 		 305 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.07 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.35 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  36.51 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  39.37 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  37.61 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  39.51 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  37.5 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.86 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 308 aa  168  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 312 aa  168  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.46 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  38.36 
 
 		 307 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.79 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  38.33 
 
 		 578 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  33.33 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 305 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 		 321 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  38.84 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  36.04 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.87 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  36.49 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  37.02 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.32 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  37.18 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>