More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3975 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  73.01 
 
 		 287 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 287 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  70.59 
 
 		 287 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  70.59 
 
 		 287 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  70.59 
 
 		 287 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  70.24 
 
 		 287 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  70.24 
 
 		 287 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  69.9 
 
 		 287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  69.9 
 
 		 287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  66.08 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  65.97 
 
 		 280 aa  374  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  64.71 
 
 		 280 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  64.71 
 
 		 283 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  60.35 
 
 		 284 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  36.96 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  38.64 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  29.39 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  32.78 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  31.09 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  32.43 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  28.28 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  40.59 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  36.61 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  31.76 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  31.58 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  27.05 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.21 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.51 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  38.16 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  28.3 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.52 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  28.52 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  29.5 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  32.5 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  34.93 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  31.1 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  28.38 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  28.38 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  27.84 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.16 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  31.75 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  27.85 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  27.57 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  35.96 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  30.83 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  34.9 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  34.67 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  30 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.87 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  29.69 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  28.89 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  29.69 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.78 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  27.23 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  35.75 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.65 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  26.23 
 
 		 265 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32 
 
 		 302 aa  118  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  29.73 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  33.77 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  26.21 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  30.42 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>