61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3969 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  58.23 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  60.76 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  59.49 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  55.95 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  59.49 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  56.96 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  55.7 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  55.7 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  59.74 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  58.75 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  53.95 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  44.05 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  39.51 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  39.24 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  38.82 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  35.8 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  38.27 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  38.27 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  38.27 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  38.27 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  37.04 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  34.57 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  34.57 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  34.18 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  27.5 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  32.91 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  31.65 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  30.49 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  35.53 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  30.49 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  33.75 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  34.15 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  30.77 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0713  acetyltransferase  33.78 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  31.17 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0155  acetyltransferase  41.51 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  29.11 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  32.47 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  25.58 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  32.47 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  29.07 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  29.87 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0299  hypothetical protein  45.45 
 
 		 98 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  28.75 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  28.57 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  36.76 
 
 		 93 aa  40  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>