253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3968 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  290  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  72.14 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  70.71 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  70 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  66.43 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  67.14 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  67.14 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  67.86 
 
 		 150 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  67.14 
 
 		 154 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  67.86 
 
 		 142 aa  203  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  59.71 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  55.88 
 
 		 149 aa  166  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  59.2 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  52.14 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  53.57 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  31.16 
 
 		 161 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  30.4 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30.08 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30.22 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  29.13 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 140 aa  66.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.18 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  29.55 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  29.89 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.27 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  29.5 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  22.61 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.52 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  26.61 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>