25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3967 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  699    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  50.89 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  50.89 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  50.89 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  50.89 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  49.06 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  50 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  47.99 
 
 		 352 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  44.87 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  45.09 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  41.09 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  40.24 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  40.24 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  41.75 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  33.24 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  32.08 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  57.81 
 
 		 137 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  32.21 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  32.21 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  32.21 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  32.21 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  31.54 
 
 		 693 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  31.54 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  31.54 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1466  hypothetical protein  29.25 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>