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for query gene Sfri_3873 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 125 aa  259  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  88 
 
 		 134 aa  239  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  82.11 
 
 		 125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.32 
 
 		 128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  65.04 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  65.04 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  64.52 
 
 		 128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  64.52 
 
 		 128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  64.52 
 
 		 128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  65.6 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  63.71 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  65.04 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.17 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.74 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.37 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.8 
 
 		 132 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  60.98 
 
 		 132 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.32 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
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NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  61.76 
 
 		 109 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
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NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  67.01 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.72 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.8 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  60 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165068 
 
 
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NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.56 
 
 		 260 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  52.85 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  59.17 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
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NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  59.17 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.89 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  52.89 
 
 		 275 aa  140  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  59.17 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
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NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  59.17 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  59.17 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  58.33 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
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NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  56.03 
 
 		 261 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.62 
 
 		 299 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  48.33 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
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NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  47.9 
 
 		 295 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
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NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.08 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.44 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
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NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  33.88 
 
 		 380 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  38.33 
 
 		 363 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  46.24 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.65 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
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NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  36.36 
 
 		 373 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.35 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  38.38 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.32 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  37.23 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  45.35 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.37 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  45.35 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  34.29 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6128  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  35.66 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.58 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.58 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  35.29 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.61 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  32.28 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3442  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.4 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3235  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.37 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  43.75 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
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NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.29 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  45.12 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 		 393 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
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