More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3765 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  80.14 
 
 		 443 aa  721    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  80.14 
 
 		 443 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  87.07 
 
 		 441 aa  786    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.43 
 
 		 442 aa  793    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.91 
 
 		 443 aa  704    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.48 
 
 		 440 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  80.14 
 
 		 443 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.49 
 
 		 443 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.85 
 
 		 440 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.26 
 
 		 443 aa  715    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  80.14 
 
 		 443 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  80.14 
 
 		 443 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.27 
 
 		 446 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  85.49 
 
 		 441 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.5 
 
 		 445 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03516  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.67 
 
 		 442 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.2 
 
 		 442 aa  792    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  85.75 
 
 		 442 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  80.14 
 
 		 443 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.56 
 
 		 443 aa  710    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.91 
 
 		 443 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.05 
 
 		 444 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.2 
 
 		 442 aa  792    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  85.94 
 
 		 441 aa  788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  85.26 
 
 		 441 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  80.14 
 
 		 443 aa  721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2698  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.34 
 
 		 438 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.408772  decreased coverage  0.000313907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  80.14 
 
 		 443 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  90.93 
 
 		 441 aa  831    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0003  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.85 
 
 		 444 aa  661    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.834513 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.23 
 
 		 446 aa  690    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.17 
 
 		 441 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  77.65 
 
 		 443 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.04 
 
 		 443 aa  718    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.07 
 
 		 443 aa  695    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.65 
 
 		 442 aa  792    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.65 
 
 		 442 aa  792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.2 
 
 		 440 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 		 441 aa  903    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.56 
 
 		 443 aa  711    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.46 
 
 		 443 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  81.26 
 
 		 443 aa  713    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2739  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  77.25 
 
 		 444 aa  695    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  71.69 
 
 		 444 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.65 
 
 		 442 aa  792    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  77.88 
 
 		 443 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.1 
 
 		 443 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  86.2 
 
 		 442 aa  792    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.73 
 
 		 447 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.17 
 
 		 446 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.07 
 
 		 443 aa  633  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  70.27 
 
 		 445 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.73 
 
 		 447 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0463  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.51 
 
 		 447 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5791  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.01 
 
 		 447 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.51 
 
 		 447 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  70.56 
 
 		 447 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.04 
 
 		 440 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000086324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0396  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.82 
 
 		 445 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0695  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.64 
 
 		 441 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.71 
 
 		 446 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0678  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.64 
 
 		 441 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.49 
 
 		 446 aa  608  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2341  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  69.48 
 
 		 447 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.320663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.99 
 
 		 443 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.51 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.97 
 
 		 440 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.76 
 
 		 438 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.83 
 
 		 443 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1460  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3435  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.97 
 
 		 440 aa  594  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.341548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.01 
 
 		 443 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.89 
 
 		 442 aa  589  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0827  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.63 
 
 		 459 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.198289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.34 
 
 		 438 aa  588  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0789  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.72 
 
 		 445 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.01 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0115  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  66.59 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.928834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4560  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.08 
 
 		 441 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0738  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.41 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 		 439 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3471  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.11 
 
 		 457 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.31 
 
 		 447 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.62 
 
 		 448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2748  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  64.93 
 
 		 440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.47 
 
 		 447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.47 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2368  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  64.93 
 
 		 440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.421768  hitchhiker  0.00000674723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.17 
 
 		 448 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.29 
 
 		 448 aa  579  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0909  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>