144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3730 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  72.83 
 
 		 473 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  74.14 
 
 		 489 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  74.37 
 
 		 489 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 477 aa  975    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  74.31 
 
 		 489 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  74.37 
 
 		 493 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  71.69 
 
 		 467 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  73.27 
 
 		 489 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  72.31 
 
 		 473 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  72.36 
 
 		 463 aa  672    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  73.27 
 
 		 489 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  72.27 
 
 		 465 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  73.27 
 
 		 473 aa  671    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  67.69 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  63.85 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  42.67 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  43.35 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  41.44 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  41.56 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  41.03 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  40.53 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  30.39 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  30.7 
 
 		 583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 587 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 483 aa  136  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.9 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.2 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  21.46 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  18.44 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.32 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.32 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  23.08 
 
 		 453 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 1496 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.07 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 635 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 627 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  22.4 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.07 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.64 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.58 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 525 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 731 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.22 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.43 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  20.93 
 
 		 565 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  20.25 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.5 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  26.16 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 421 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 421 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 375 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  21.47 
 
 		 460 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.96 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>