98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3715 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  68.25 
 
 		 324 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  68.44 
 
 		 324 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  68.25 
 
 		 324 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.3 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  66.03 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  66.56 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  66.56 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  66.24 
 
 		 349 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  66.24 
 
 		 329 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  65.83 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  63.19 
 
 		 320 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  60.4 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  49.83 
 
 		 321 aa  292  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  33.12 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  35.79 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  34.94 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  34.85 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  31.82 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  32.56 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  33.66 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  32.78 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  29.94 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  30.82 
 
 		 328 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  30.82 
 
 		 328 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  32.33 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  32.81 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  32.03 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  31.64 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  28.87 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  27.84 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  28.52 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  27.84 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  27.84 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  27.84 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  27.84 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  27.48 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  28.18 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  22.75 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.43 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.31 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  28.1 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.73 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  29.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.73 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  22.9 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  22.08 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  21.7 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  26.77 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  24.76 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.75 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  24.51 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.01 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  23.67 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  29.6 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  23.81 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  21.11 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.37 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  25.91 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  25.11 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.97 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.97 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.97 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  23.05 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.97 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  28.42 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  31.52 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  24.37 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  29.93 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  20.85 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.56 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  20.85 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  28.12 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  29.93 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  22.54 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.72 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  29.93 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25.1 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  25.37 
 
 		 512 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>