122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3655 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0436  hypothetical protein  96.91 
 
 		 162 aa  313  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00784425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0780  hypothetical protein  91.93 
 
 		 164 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3725  hypothetical protein  85.71 
 
 		 164 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3851  hypothetical protein  85.71 
 
 		 164 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3668  hypothetical protein  85.71 
 
 		 164 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.118078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0673  hypothetical protein  87.65 
 
 		 162 aa  277  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3997  hypothetical protein  86.42 
 
 		 162 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0646  hypothetical protein  85.8 
 
 		 162 aa  269  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3376  hypothetical protein  85.8 
 
 		 162 aa  269  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.879379  hitchhiker  0.00180507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0644  hypothetical protein  85.8 
 
 		 162 aa  269  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.257597  hitchhiker  0.000000179995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3411  hypothetical protein  75.16 
 
 		 165 aa  260  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60530  hypothetical protein  75.16 
 
 		 162 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012244  normal  0.488728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5214  hypothetical protein  75.16 
 
 		 162 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000310717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2587  hypothetical protein  78.4 
 
 		 162 aa  250  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3161  hypothetical protein  69.75 
 
 		 168 aa  248  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.604205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02877  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0695  conserved hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02827  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3181  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3471  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4314  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0692  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3288  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3431  hypothetical protein  73.29 
 
 		 164 aa  244  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3407  hypothetical protein  70.81 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3401  hypothetical protein  70.81 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.572659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3336  hypothetical protein  70.81 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.568765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3327  hypothetical protein  70.81 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3502  hypothetical protein  70.19 
 
 		 164 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2386  hypothetical protein  72.05 
 
 		 164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0431  hypothetical protein  72.67 
 
 		 168 aa  236  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4583  hypothetical protein  72.67 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4257  hypothetical protein  72.67 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3230  hypothetical protein  72.67 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0016  hypothetical protein  66.67 
 
 		 162 aa  233  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0512  hypothetical protein  72.05 
 
 		 168 aa  233  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40830  hypothetical protein  65.22 
 
 		 164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0682  hypothetical protein  69.57 
 
 		 162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0713  hypothetical protein  69.57 
 
 		 162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.028943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0714  hypothetical protein  69.57 
 
 		 162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4503  hypothetical protein  68.94 
 
 		 162 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.55256  normal  0.737083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1202  hypothetical protein  69.57 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000824921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4866  hypothetical protein  66.46 
 
 		 162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0033  hypothetical protein  55.9 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3669  hypothetical protein  48.77 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2816  hypothetical protein  47.5 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.681975  normal  0.0187952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1788  hypothetical protein  45.68 
 
 		 174 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3084  hypothetical protein  47.5 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1525  hypothetical protein  44.51 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00081824  normal  0.11672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3326  hypothetical protein  42.5 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1880  hypothetical protein  46.88 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2515  hypothetical protein  46.63 
 
 		 174 aa  140  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1628  hypothetical protein  42.14 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511359  normal  0.669453 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1342  hypothetical protein  45.68 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0069  hypothetical protein  42.14 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0497  hypothetical protein  42.33 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0230  hypothetical protein  44.3 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0594  hypothetical protein  41.51 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0463064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2543  hypothetical protein  39.38 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2272  hypothetical protein  38.75 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00317915  normal  0.0200379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2231  hypothetical protein  39.38 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2181  hypothetical protein  41.72 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1808  hypothetical protein  40.13 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2232  hypothetical protein  37.34 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2111  hypothetical protein  37.34 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1940  hypothetical protein  36.08 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5522  hypothetical protein  37.34 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5884  hypothetical protein  37.27 
 
 		 194 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2193  hypothetical protein  37.27 
 
 		 194 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2218  hypothetical protein  37.27 
 
 		 194 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1083  hypothetical protein  37.34 
 
 		 194 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1937  hypothetical protein  37.34 
 
 		 234 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.806268  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2019  hypothetical protein  37.34 
 
 		 234 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.120969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0792  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1084  hypothetical protein  37.34 
 
 		 234 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0625  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0528  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2057  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3135  hypothetical protein  36.08 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177362  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3282  hypothetical protein  39.38 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1414  hypothetical protein  36.08 
 
 		 203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0531189  normal  0.0304198 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1796  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3606  hypothetical protein  39.38 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1384  hypothetical protein  37.99 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1847  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1844  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3450  hypothetical protein  37.04 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.603459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3064  hypothetical protein  37.71 
 
 		 197 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2480  hypothetical protein  34.52 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0339  hypothetical protein  43.4 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.818951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2881  hypothetical protein  36.31 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  0.292612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0345  hypothetical protein  42.14 
 
 		 188 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0682824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2908  hypothetical protein  34.32 
 
 		 197 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00873066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2101  hypothetical protein  36.71 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.175881  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3481  hypothetical protein  38.12 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1954  hypothetical protein  36.31 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0709272  normal  0.160176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2048  hypothetical protein  35.75 
 
 		 200 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0494  hypothetical protein  43.4 
 
 		 188 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1066  hypothetical protein  36.26 
 
 		 203 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>