220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3626 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  87.56 
 
 		 209 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  87.08 
 
 		 209 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  87.08 
 
 		 209 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  87.08 
 
 		 209 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  87.08 
 
 		 209 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  86.54 
 
 		 210 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  83.73 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  85.29 
 
 		 208 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  84.31 
 
 		 208 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  83.82 
 
 		 208 aa  370  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  74.4 
 
 		 212 aa  338  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  71.77 
 
 		 209 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  71.64 
 
 		 207 aa  311  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  60.2 
 
 		 202 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  61.27 
 
 		 209 aa  268  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  59.51 
 
 		 206 aa  262  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  59.31 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.8 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  59.51 
 
 		 207 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  59.51 
 
 		 207 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  60.2 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  61 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  58.21 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  57 
 
 		 207 aa  254  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  57.28 
 
 		 209 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  56.8 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  58.79 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  58.94 
 
 		 208 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  58.94 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  57.84 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  58.79 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  57.97 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  58.71 
 
 		 201 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  57.97 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  57.29 
 
 		 205 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  57.49 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  56.52 
 
 		 207 aa  245  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  58.82 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  55.17 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  54.23 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  52.26 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  50.48 
 
 		 208 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  53.2 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  53.43 
 
 		 203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  51.23 
 
 		 184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  51.72 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  50.24 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  49.25 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  46.38 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  47.42 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  62.69 
 
 		 140 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.96 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  43.35 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  45.3 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  43.41 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  44.75 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  43.96 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  43.98 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  39.79 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  44 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  44 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.5 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  42.5 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  45.86 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.27 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  42.79 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  40.61 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  42.51 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.21 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  39.56 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  45.62 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  40.21 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  43.18 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  39.79 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  39.79 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  37.14 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  36.89 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  32.49 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  35.83 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  33.84 
 
 		 292 aa  118  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  34.22 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.42 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  35.05 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.9 
 
 		 294 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  37.63 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  34.38 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.02 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.95 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.64 
 
 		 228 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  34.38 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.93 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  36.08 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.87 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  36.21 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.8 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>