More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3595 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  699    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  74.55 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  74.55 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  74.33 
 
 		 380 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  74.25 
 
 		 335 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  74.25 
 
 		 335 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  73.13 
 
 		 363 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  73.95 
 
 		 350 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  74.63 
 
 		 335 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  74.63 
 
 		 335 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  71.56 
 
 		 335 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  71.26 
 
 		 335 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  73.9 
 
 		 321 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  68.56 
 
 		 353 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  50.89 
 
 		 338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  50.47 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  47.92 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  48.54 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  47.08 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  32.62 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  32.04 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  32.04 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  29.19 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  28.75 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  29.23 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  28.12 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  31.15 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  31.45 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  28.77 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  30.74 
 
 		 398 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  30.74 
 
 		 398 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  29.7 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.52 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.56 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  30.33 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.03 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.48 
 
 		 699 aa  99.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  31.95 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.03 
 
 		 399 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  25.85 
 
 		 390 aa  99.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.09 
 
 		 701 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  32.85 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  31.15 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  29.66 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  31.15 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  32.49 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  29.33 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  27.96 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  27.96 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  26.35 
 
 		 399 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  27.96 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  26.35 
 
 		 399 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  29.66 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  26.35 
 
 		 399 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  25.75 
 
 		 391 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.19 
 
 		 399 aa  96.3  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  26.35 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  26.35 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  26.01 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  26.35 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  26.01 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  34.27 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.65 
 
 		 394 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  30.42 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  31.48 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  28.32 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  28.37 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  25 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  26.73 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  27.6 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  28.2 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  30.4 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.57 
 
 		 713 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  27.96 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  27.69 
 
 		 433 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  27.94 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  32.52 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  25.63 
 
 		 392 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  25.74 
 
 		 403 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.39 
 
 		 713 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.38 
 
 		 711 aa  93.2  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.39 
 
 		 713 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  32.04 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  28.14 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  27.3 
 
 		 493 aa  92.8  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  26.98 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  28.33 
 
 		 398 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  29.04 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  27.13 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>