196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3490 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 
95 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  76.92 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  78.02 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  60.87 
 
 
98 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  61.54 
 
 
94 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  51.69 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  62.86 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  62.86 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  62.86 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  62.86 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  62.86 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  62.86 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  51.65 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  51.61 
 
 
91 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  60 
 
 
90 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  60 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  60 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  60 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  57.5 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  56.16 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  58.57 
 
 
95 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  51.09 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  58.57 
 
 
95 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  60 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  51.22 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  57.14 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  59.42 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  58.82 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  47.13 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  51.09 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  51.69 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  45.88 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  52.86 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  50 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  42.39 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  43.33 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.54 
 
 
61 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  46.67 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  35.56 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  35.56 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  38.64 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
838 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.7 
 
 
68 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  35.82 
 
 
71 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
1087 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
816 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  30.38 
 
 
954 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
699 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.7 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.7 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  30.88 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
758 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  37.5 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  37.18 
 
 
857 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
758 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  39.13 
 
 
209 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
1071 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
818 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 
797 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  35 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
753 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
761 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
759 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
759 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
804 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
837 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
946 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  29.73 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
867 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
871 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
751 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
887 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
748 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
826 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
758 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
797 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4626  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
754 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.617338  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
761 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
861 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
795 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
836 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  32.86 
 
 
833 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
752 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
825 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
836 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
836 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
802 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
813 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
866 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
839 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
937 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  25.71 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>