38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3442 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  100 
 
 		 600 aa  1249    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  100 
 
 		 600 aa  1249    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  30.25 
 
 		 533 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  42.19 
 
 		 236 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  28.7 
 
 		 606 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.25 
 
 		 617 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.04 
 
 		 650 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  32.33 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.41 
 
 		 650 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  24.29 
 
 		 616 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  27.11 
 
 		 688 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  25.35 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  25.35 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  24.68 
 
 		 707 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  38.27 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  27.68 
 
 		 289 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  24.8 
 
 		 717 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.62 
 
 		 700 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  28.42 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  28.42 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  28.42 
 
 		 624 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 694 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  20.69 
 
 		 683 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  20.69 
 
 		 683 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  23.6 
 
 		 714 aa  50.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  22.74 
 
 		 721 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  22.84 
 
 		 475 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  25.27 
 
 		 682 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  23.39 
 
 		 713 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6480  integrase family protein  23.78 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0910759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7326  integrase family protein  23.78 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677139  hitchhiker  0.00388459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0248  integrase family protein  23.78 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 304 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.12 
 
 		 302 aa  43.5  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>